正確答案：D

試題解析：小兒秋季腹瀉的主要病原體是輪狀病毒（D對）；金黃色葡萄球菌腸炎多繼發于使用大量抗生素后，病菌為金黃色葡萄球菌（A錯）；侵襲性大腸埃希菌和耶爾森菌除侵襲小腸、結腸黏膜外，還可產生腸毒素，引起侵襲性腹瀉，以夏季多見（BC錯）；柯薩奇病毒也可引起腹瀉，但較少見（E錯）。