正確答案：E

試題解析：先天性甲狀腺功能減退病因：
1. 甲狀腺不發育或發育不良是造成先天性甲狀腺功能低下的最主要原因。
2. 甲狀腺激素合成途徑缺陷
3. 激素缺乏
4. 母親在妊娠期應用抗甲狀腺藥物
5. 器官反應性低下
6. 碘缺乏
外傷不是先天性甲狀腺功能低下的主要原因。（E錯，本題選E）